根据上海市发明协会的要求，研究生院组织相关院系的研究生申报了“2012年度科创杯上海高校学生创造发明奖”。此次共推选了六个院系的13个项目参加“科创杯”研究生组的评奖。最终，有8个项目获奖，其中一等奖1项、二等奖1项、三等奖6项。
2012年度复旦大学获“科创杯”上海高校学生创造发明奖一览表
| 姓 名 | 项 目 名 称 | 获奖院系 | |
| 一等奖 | 余北 王振宇 陈迟晓 顾薇如 | 高速、高精度、高能效模数转换器设计 | 信息学院 |
| 二等奖 | 王明硕 张楷晨 傅海鹏 蔡德鋆 | 载波体制超宽带无线通信物理层芯片设计关键技术 | 信息学院 |
| 三等奖 | 杜东书 | 声、光、电可编程随机刺激器 | 基础医学院 |
| 秦 罡 | 基于中文语义与全文索引的电子行业垂直搜索引擎 | 物理系 | |
| 韩 亮 | 新型肿瘤靶向纳米药物递送载体 | 药学院 | |
| 刘晓丽 | 一种穿膜肽修饰的纳米粒及其制备方法 | 药学院 | |
| 李 莹 | 一种双重靶向的D构型多肽及其递药系统 | 药学院 | |
| 刘 涛 | 新型天然抗菌药物的研究与开发 | 药学院 |
